微生物实验室是市政环境实验教学中心下设的专业实验室之一，主要服务给水排水科学与工程、环境工程、环境科学专业的师生开展实验教学和开放性实验活动。

主要承担《水处理微生物学》、《环境微生物学》和《污染控制微生物学》课程内实验教学任务，具有生物显微镜、恒温培养箱、无菌操作台、高压灭菌器、电冰箱、鼓风干燥箱等主要设备，并配备大肠杆菌、枯草杆菌、四联球菌等教学用菌群标本。该室基础设施齐全完善实验教学仪器设备性能良好，完全满足教学和开放实验要求。

开设实验项目：光学显微镜的操作及微生物个体形态的观察（开放）、微型动物计数、细菌霉菌酵母菌放线菌形态的观察（开放）、微生物的染色、培养基的制备及灭菌、细菌纯种分离培养和接种技术、细菌总数的测定、大肠菌群数的测定、微生物细胞大小的测量等10个项目实验。

微生物实验室同时还承担开放实验的项目2项，面向给水排水科学与工程、环境工程、环境科学的专业有兴趣的学生开放。开放预约责任教师吕 臻，联系方式QQ群。

微生物实验室一直秉着负责、高效的原则为全院师生提供优质服务保障。